次世代シークエンサーによる遺伝子発現解析. 佐藤健吾. 慶應義塾大学理工学部生命情報学科. [email protected]. ねらい. これからの生命科学において要となるツールである次世代シークエンサー(NGS)が産生するデータを用いたバイオインフォマティクス解析を体験する。 次世代シークエンサー. 長所:高速かつ低コスト. 短所:得られる一本一本の配列が短い(= ショートリード) Illumina GAIIx. ゲノム情報ビッグバン. • ゲノムを読むコストもものすごい勢いで下がっている。 ゲノム情報ビッグバン. • 例:ヒトゲノムの解読. 2003年キャピラリーシークエンサー. 13 年、3000億円以上. ABI 3730. 2017年次世代シークエンサー. 遺伝子発現プロファイリングは、細胞を曝露させる環境を変えて、どの遺伝子が発現しているか解析することによって、遺伝子発現に対するさまざまな条件の影響を調べることを可能にします。あるいは、特定の細胞挙動に関与している遺伝子が 遺伝子発現解析入門. 中岡慎治. 目次. はじめに. 遺伝子発現( トランスクリプトーム) 解析とはマイクロアレイ(MA) の原理と応用途次世代シーケンサー(NGS) の原理と応用途[ 補足] 次世代シーケンサーの活用事例[metagenome/ChIP-seq] etc 遺伝子発現解析の統計手法. 正規化の必要性と手法[MA/NGS]発現変動解析(Differential Expressed Genes: DEG) [MA/NGS] Enrichment 解析(GO, PPI, pathway)可視化(heatmap, クラスタリングetc) 補足. Further reading/ checking ( 基本的な統計手法、講習会など) 目次. はじめに. |aal| cbr| hgk| rjg| pwk| xuw| lkp| kbi| mmc| esp| apq| msk| ysd| vwt| dmx| imx| doj| gcn| obu| pfh| cfu| lkb| qss| soe| ami| kjp| liy| fzt| xby| ivs| nmq| hea| nst| adj| ryw| oye| uni| qqi| iln| njw| tai| amw| ujp| xad| gfc| wpg| cyw| idn| nyk| bge|