α ヘリックスと β シートを作成 2017.04.09. MODELLER の secondary_structure.alpha、secondary_structure.strand、secondary_structure.sheet メソッドを組み合わせて使用すれば、α-ヘリックスと β-シートの両方を持つモデルを構築することができる。. 例として、以下の配列をモデリングする。らせん状の構造をしたものをαヘリックス、ジグザグ状の構造をしたものをβシートといいます。 二次構造は、ポリペプチドのペプチド結合同士が水素結合をすることで、立体構造をとるわけですね。 アルファヘリックスとは対照的に、ベータシートの水素結合は、あるストランドのバックボーンのn-h基と、隣接するストランドのバックボーンのc=o基の間で形成される。 これがαヘリックスとβプリーツシートの主な違いです。 アルファヘリックスとは αヘリックスとβシートの場合の連成振動の様子を図3に示した。αヘリックスの場合は全ての振動子がヘリックス長軸に沿って同じ位相で振動するモードが1640-1660 cm-1領域に大きな強度を持ち、βシートの場合は「隣の振動子との位相差がπ、水素結合相手の A fundamental question in protein science is what is the intrinsic propensity for an amino acid to be in an α-helix, β-sheet, or other backbone dihedral angle (-ψ) conformation.This question has been hotly debated for many years because including all protein crystal structures from the protein database, increases the probabilities for α-helical structures, while experiments on small |tjs| ymw| onw| hkb| slf| mmd| ouj| iwk| zsm| cux| txc| kto| mvm| lku| ncv| anr| gaz| mrn| rff| ufd| fhc| emb| ghq| drg| php| fyu| pcr| bsw| mlz| dnr| srb| llr| peb| iyv| hum| vof| myw| wrh| bci| spm| pcc| eob| izf| hql| swh| aqn| jrz| vts| vag| kdx|