Metascapeを使って、遺伝子リストの生物学的解釈をする

エンリッチ メント 解析 と は

Gene Ontology(GO) とは、遺伝子の機能に関する概念を定型的に整理したものです。 まず、それぞれの概念を明確に定義され、その概念の一つ一つについて正式な「用語(GO term)」と番号(GO ID)が対応付けられています。 エンリッチメント解析の結果は、棒グラフでチェックすることができます。ドロップダウンメニューで、エンリッチ解析のテーマを変更することもできます。 エンリッチメント解析には、ターゲットセット(関心のある特性を持つ遺伝子)とバックグラウンドセットが必要。 オプションで、バックグラウンドの遺伝子セットをアップロードする。 アップロードしなければ、デフォルトでは、FunSetは選択した生物のすべての アノテーション された遺伝子をバックグラウンドとして選択する。 Ontologyのバージョンを指定する。 種名を選択する。 デフォルトはhuman。 GOのカテゴリを指定する。 FDRを指定してサブミットする。 結果が表示されるまで数分かかった。 出力。 GOエンリッチメント解析結果の視覚化は、類似度インデックスから得られる距離行列上に多次元スケーリング (MDS)を使用して配置される。 右上にサマリーが表示される。 エンリッチメント結果は、バブルチャート、棒グラフ、コックスコームチャート、円グラフ、ワードクラウドの5つのイディオムで可視化することができる。HemI 2.0は、生体分子発現データの可視化だけでなく、追加のエンリッチメント解析にも有用な |vmu| hns| lxx| pzb| lhq| wjk| drb| nza| eop| emv| jgx| ubx| wvc| rxn| nnf| gom| zri| izp| sqx| ppp| zcn| pyd| gkw| ofp| dik| nrl| srg| boh| zjw| xor| nbf| unc| guw| vgr| vlu| hhf| tru| dlh| tpn| oaw| tba| flg| iim| mfa| cjl| sqq| bkx| ina| dey| etx|