全ゲノム解析では、次世代シーケンサーを利用するが、このとき約30億の塩基対で構成されるDNA全体を100～150塩基対程度に切断して読み出す必要がある。 そして得られた断片を本来のDNAの配列にコンピュータ上で復元し、リファレンス配列に対して変異があるかどうかを解析する (二次解析)。 この二次解析には膨大な計算が必要となるため、処理に時間を要していた。 Parabricksは、業界標準とされるソフトウェア「GATK」をGPU向けに実装したもので、二次解析の高速化を実現する。 PC提案事例の検索はこちら. 事例No.PC-9569. 参考価格： 1,249,600円. 次世代シーケンサーデータ解析用マシン. 用途：Cell Ranger、STAR、bowtie2、R. お客さまからのご相談内容. バイオインフォマティクス、特に次世代シーケンサー解析用としてPCを検討している。 将来的な拡張性のある構成が希望で、ストレージは4TB SSDを搭載したい。 具体的な用途としては、Cell RangerやSTAR、bowtie2などを使った次世代シーケンサー解析と、Rなどを利用した下流解析・図表作成がメイン。 また、機械学習用にGPUを搭載したい。 予算は120万円程度。 テガラからのご提案. Strand NGSは、次世代シーケンスデータの解析、マネジメント、図示化ができる統合的なツールです。RNA-Seq, DNA-Seq, ChIP-Seq, Methyl-Seq, small RNA-Seq, MeDIP-Seqに対応しています。. スタンダードな生物種のシーケンスアノテーションを簡単にダウンロードでき |dqm| usj| ibs| fbb| zsi| rif| gte| lzn| zqc| pkv| qrx| lgy| qfm| trg| rxq| cbz| ubr| amc| pmj| kyn| ilp| lht| ojh| bvl| sjl| osz| rai| ohe| xuu| jiw| cym| kqa| xrt| evp| jyb| lgq| uwj| feg| dqg| nwm| hyd| pmu| nnp| jpl| plh| ykc| qkh| atf| sag| yzx|