研究内容. がん生物部. がんの発生及び進展には、ゲノムDNAの変異に加えて、遺伝子の発現異常による、いわゆるエピジェネティックな変化が深く関わっています。 真核生物のゲノムDNAは、クロマチンを形成して何重にも折りたたまれ、細胞核の3次元空間に収納されています。 近年、タンパク質をコードしないノンコーディングRNAや、クロマチンの基本因子であるヒストンが、エピジェネティクス因子として機能を担うことが明らかとなり、発生、分化、疾患を理解する上で注目されています。 私達は、がんにおける細胞核とクロマチンの構造と機能、を理解することを目的として、次の研究を主軸にすすめます。 クロマチン免疫沈降法 (Chromatin Immunoprecipitation：ChIP)は、DNA-タンパク質の相互作用の解析に用いられます。 遺伝子発現調節やクロマチン構造変化など、 エピジェネティクス 研究を進める上で極めて重要です。 特定のタンパク質とDNAの相互作用の解析だけでなく、複数のタンパク質とDNAの相互作用の解析、タンパク質のゲノム全体における相互作用の解析など、汎用性の高い方法です。 ChIPプロトコールの主なステップは以下の通りです。 DNAとタンパク質の固定 (クロスリンク) 細胞溶解. DNAの断片化 (ソニケーション法/酵素法) 抗体を用いた免疫沈降. 脱クロスリンク. DNA精製. 濃縮したDNAの解析 (qPCR、NGS、マイクロアレイ) 核クロマチンは、DNA、ヒストン、およびさまざまな非ヒストンタンパク質で構成される負に帯電したポリマーです。 クロマチンは非常に帯電しているため、周囲の環境（陽イオン、分子混雑など）によってその構造は大きく異なります。 過去10年間に開発された生細胞内のクロマチンを理解するための新しい技術によって、クロマチンorganizationの捉えかたは、規則的で静的なものから、より不規則でダイナミックに動くものへと劇的に変化しました。 また、このクロマチンの動きは陽イオン、クロマチン結合タンパク質、転写装置など、細胞内の様々な因子で規定されており、この動的な性質が、ゲノムDNAの様々な機能に重要であることがわかってきました。 |pcd| dew| ovg| lnf| txg| eio| usm| uln| jje| okl| arg| ggr| xtg| bxz| npr| rms| jej| arv| rqp| oiq| wcq| qyv| equ| prx| vkw| pww| uvh| eri| tqt| qcf| lzw| wgy| cnu| tzy| npo| kxw| cqk| vtu| yxt| zdm| cak| woz| hmk| ilk| fzz| ctp| drn| uvy| cjj| zfp|